Decorreu, nos dias 8 e 9 de junho, no Luxemburgo, mais uma sessão do Conselho Justiça e Assuntos Internos, a última sob presidência maltesa. O Conselho debateu o ponto de situação da migração, a política de retorno e a reforma do sistema europeu comum de asilo e reinstalação. A reunião em causa debruçou-se igualmente sobre o futuro sistema europeu de informação e autorização de viagem, o sistema de informação Schengen e a interoperabilidade dos sistemas de informação, bem como a luta antiterrorista. Em sessão conjunta com os ministros da justiça, foi debatida a justiça penal no ciberespaço e a proteção das crianças migrantes.
Foram apresentadas as prioridades da próxima Presidência do Conselho, que será assumida pela Estónia, a 1 de julho de 2017.